انیمیشن "تبدیل‌شوندگان" داستانی حماسی و علمی-تخیلی است که به پیدایش نژاد تبدیل‌شوندگان و آغاز رابطه‌ای پیچیده و سرنوشت‌ساز میان دو روبات به نام اوریون پکس و دی شانزده می‌پردازد. این دو روبات همرزم، که در ابتدا در کنار یکدیگر در سیاره سایبرترون جنگ می‌کنند، به تدریج در اثر تفاوت‌های دیدگاه‌های فلسفی و ایدئولوژیکی به دو دشمن خونین تبدیل می‌شوند. اوریون پکس که بعداً به اوپتیموس پرایم تبدیل می‌شود، رهبری گروه "اتوبات‌ها" را بر عهده می‌گیرد و در تلاش است تا امنیت و آزادی سیاره سایبرترون و ساکنان آن را حفظ کند. در مقابل، دی شانزده که بعدها به مگاترون تبدیل می‌شود، رهبری "دسپتیکان‌ها" را به دست می‌گیرد و هدف او سلطه‌جویی و استفاده از قدرت‌های سایبرترون برای رسیدن به اهداف خود است.
این دو روبات در ابتدا هم‌مسلک و متحد بودند، اما با گذشت زمان اختلافات فلسفی و ایدئولوژیک آن‌ها بر سر چگونگی اداره سیاره سایبرترون و آینده این سیاره باعث می‌شود که رابطه‌شان به نزاعی خونین تبدیل شود. اوپتیموس پرایم با آرمان‌هایی چون آزادی، برابری و حفظ صلح و مگاترون با اهدافی چون سلطه، قدرت و تسلط بر جهان به دشمنان خونین یکدیگر تبدیل می‌شوند. این درگیری‌ها نه تنها به نبردهای شدیدی بین اتوبات‌ها و دسپتیکان‌ها منجر می‌شود، بلکه پایه‌گذار جنگی است که سایبرترون را درگیر دگرگونی‌ها و ویرانی‌هایی عظیم می‌کند.
این داستان به نحوی نمادین به مسأله‌های فلسفی و انسانی مانند آزادی، قدرت، فساد و وفاداری می‌پردازد. رابطه اوریون پکس و دی شانزده، که از همکاری و همدلی به دشمنی و جنگ تبدیل می‌شود، نشان‌دهنده پیچیدگی‌های اخلاقی و تصمیمات سختی است که شخصیت‌ها در طول زندگی خود با آن‌ها مواجه می‌شوند. تبدیل شدن این دو شخصیت به اوپتیموس پرایم و مگاترون، نمایانگر تحولی عمیق است که نه تنها در شخصیت‌های آن‌ها، بلکه در جنگی که در آینده برای سرنوشت سایبرترون پیش خواهد آمد، تأثیرگذار خواهد بود.
